性狀：白色至淺黃色粉末，有一定吸濕性。溶於水和甘油，水溶液無色至淡黃色，有時呈乳白色，幾乎不溶於乙醇、氯仿和乙醚等有機溶劑。最適合PH值5.7(一般3～9.5皆可)，在中性或偏酸性時亦有作用，等電點18.75；最適合溫度55～60℃(一般10～85℃皆可)，耐熱性強，在90℃時也不會完全失活；受氧化劑抑制，還原性物質激活。木瓜蛋白酶是一種在酸性、中性、鹼性環境下均能分解蛋白質的蛋白酶。

在各個行業的用途：1食品工業應用：可利用酶促反應，使食品大分子的蛋白質水解成小分子肽或氨基酸。用於水解動植物蛋白、製成嫩肉粉、水解羊胎素、水解大豆、餅乾鬆化劑、麵條穩定劑、啤酒飲料澄清劑、高級口服液、保健食品、醬油釀造及酒類發酵劑等。有效轉化蛋白質的利用，大大提高食品營養價值，降低成本。有利於人體的消化和吸收。

2美容化妝品工業應用：將木瓜蛋白酶加入到含有蛋白質和油脂的化妝品中，具有獨特的美白嫩膚、美顏保健、祛斑除污垢、促進血液循環、改善肌膚等功效，提高產品檔次。可製成減肥茶、美容護膚品等。

3日化品工業應用：用於肥皂、洗滌劑、洗衣粉、洗手液等，去污力強，除菌消毒、安全放心。

4飼料工業應用：用於飼料添加劑，開發蛋白源，利於吸收，提高飼料的利用率，節約成本，有助於牲畜消化，加速生長。如在豬、牛、羊、雞、鴨、鵝、魚、蝦等飼料中添加。還可以作為蔬菜水果高級復合肥料的添加劑。5皮革工業應用：利用木瓜蛋白酶製成脫毛劑，鞣制皮革，具有毛孔細膩，皮紋光亮效果。說明：在我國，木瓜種植主要分佈在廣西的橫縣和邕寧縣等地，木瓜蛋白酶的生產和研究有將近20年的時間

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