高通量微生物及哺乳動物細胞表型芯片測定系統介紹:
表型芯片(Phenotype Microarray,簡稱PM)是與基因芯片、蛋白芯片並列的三大技術之一。PM系統收集瞭幾乎所有已經發表的微生物和細胞的常見表型,通過建立標準的評價模式、分析檢測工具及數據處理軟件,建立一個用途廣闊的平臺,可廣泛用於涉及微生物和細胞領域的所有工作者對微生物和哺乳動物細胞進行科學研究和產品開發工作,如基因功能研究、藥物研究、代謝研究、發酵條件優化、產物優化、毒性研究等等。
PM技術在國外已經應用近十年時間,由於美國對高技術的出口一直采取封鎖,PM技術直到2008年才正式進入中國,未來PM的應用前景不可估量。
技術參數:
1.可用於純種微生物或混合微生物細胞表型測試,如對單個功能菌株、混合菌株或土壤微生物菌群進行各種碳源、氮源、磷源和硫源、滲透壓、pH值及各種化學敏感物質的表型特征分析;通過測定不同作物根系微生物的碳氮磷硫應用情況,優化生物肥料中載體的營養條件,減少有害微生物的生長,促進有益土壤微生物的生長,增強作物的抗病能力;優化微生物的培養條件;工程菌株的誘變研究及其它相關的應用和基礎研究。
2 細胞表型芯片(PM)的各種PM板由主機完成培養和讀數,系統定時測定顏色變化值,最後得到表型反應的動力學圖曲線,從而定量測定表型反應的強弱。
3 系統可使用的PM板共25塊,包括碳源板2塊、氮源板4塊、磷源和硫源板1塊、生物合成路徑板1塊、滲透壓及離子板1塊、pH板1塊及化學敏感物質板10塊,酵母真菌板5塊;哺乳動物細胞相關的PMM板有13塊,包括碳源和氮源糖代謝板2塊、離心板1塊、激素板3塊、抗腫瘤藥物板4塊、線粒體毒性測試板1塊,孔內固定有凍乾的各種相應的化學物質。
4常用微生物表型測試達接近4000種,可以用於革蘭氏陰性細菌、陽性細菌、酵母、絲狀真菌及哺乳動物細胞等細胞表型的研究。
5 PM軟件可以自動比較兩個或多個樣品的上千種表型,通過對不同樣品及其表型反應的比較可以提供非常有用的信息。在兩個樣品有同樣表型反應動力學的曲線標註為黃色,某一細胞系特有的表型反應標註為指定給該細胞系的特有曲線顏色。研究開發人員可以很快地看到圖形方式的輸出結果,並從視覺上判定兩個細胞系之間的變化。兩個細胞系有顯著差異的地方,軟件會自動標註、突出顯示這個差異,並生成報告列出找到的細胞表型差異。
常用功能:
1 確定已知或未知基因的功能,發現某些特殊活性的酶;
2 微生物對營養物質的轉運、碳、氮、磷、硫源的代謝特征;
3 優化微生物培養條件,優化微生物次級代謝產物的產生;
4 確定藥物(如抗生素等)對微生物細胞的作用,研究不同藥物之間的協同或拮抗作用;
5 通過尋找致病微生物的特異基因來發現新的抗生素作用位點;
6 通過比較表型分型,測試抗生素靶向位點和藥物前體;
7 補充從基因和蛋白質水平上獲得的信息。
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