大量臨床實驗證明磁療對疼痛具有療效，有助于解除粘液囊炎、重度關節炎和頭痛帶來的痛苦，甚至還具備抗感染和抗衰老化的功效。磁療之所以有非凡的療效，是因為它能刺激分泌一種控制免疫系統和呼吸系統的內分泌。磁療具有消炎、止痛、消腫、降壓、平喘、止咳、止瀉等作用。其操作安全簡便，無副作用。
磁療法的治療作用：
 1).止痛作用磁場有明顯止痛作用。磁療常用于治療各種疼痛，如軟組織損傷痛，神經痛，炎癥性疼痛， 內臟器官疼痛和癌性疼痛等。磁療止痛效果快慢不一，多數病人在磁療后數分鐘至10分鐘即可出現止痛效果。磁療止痛作用的機制可能是多方面的。磁療改善微循環和組織代謝，因而糾正由缺血、缺氧、水腫、致痛物質聚集等所致疼痛；磁場能提高致痛物質水解酶的活性，使緩激肽、組胺、5－羥色胺等致痛物質水解或轉化；磁療還有降低神經興奮性的作用等。
 2).鎮靜作用　磁療可改善睡眠狀態，緩解肌肉痙攣，減輕面肌抽搐，減輕喘息性支氣管炎和搔癢癥等。這可能與磁場對神經系統的作用有關。中藥磁石有鎮心安神、平肝潛陽作用。
 3).消腫作用磁場有明顯抗滲出作用，這在臨床和實驗中得到證實。實驗觀察表明，磁場既有降低致炎物質（組織胺等）使血管通透性增加的作用，又能加速蛋白質從組織間隙轉移的作用，說明磁場的消腫作用與其影響通透性和膠體滲透壓有明顯關系。磁療對軟組織損傷，外傷性血腫，凍傷，燙傷，炎癥等有明顯消腫止痛的作用。
 4).消炎作用　磁場有一定消炎作用，這與磁場改善微循環、消腫、止痛和促進免疫反應性增強等有關。磁場無明顯直接抑菌作用。
 5).對冠心病和高血壓的治療作用　低強度恒磁場（15～50mT）治療冠心病或早期高血壓患者，多數病人在治療后一般狀況改善，頭痛，心區痛減輕或消失，血壓下降，脈率減慢。
 6).對腫瘤的作用　磁療對良性和惡性腫瘤有一定影響，可使良性腫瘤，如纖維瘤、脂肪瘤、毛細血管瘤、腱鞘囊腫等縮小或消失。對惡性腫瘤也有縮小腫塊及改善癥狀的作用。磁場對腫瘤作用的機制尚不清楚。
 7).抗衰老的作用新生細胞是圓形的,其含磁量是衰老細胞的幾倍乃至幾十倍.年輕人的血液含磁量高,粘度適宜,活力強,而老年人的血液含磁量低,粘稠度高,活力差,易患心腦血管疾病. 磁穴療法可以補充人體內的磁強度,提高細胞的含磁量,增強活力,延緩衰老。