4大特性
1、最短的實驗周期：從樣品制備開始隻需要8小時即可得到超過100M的高質量測序結果。
2、最便捷的樣品制備流程：隻需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、最精確的測序原理：MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學原理，數千篇高質量的國際期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結果可信度最有力的證明。
4、最完整的整合功能：MiSeq可以獨立完成簇生成，雙向測序及數據分析工作，讓經費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。
應用范圍
1、1、轉錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉錄組分析最佳平臺。公司技術團隊目前已完成瞭包括斑馬魚在內的多種植物、動物的轉錄組測序及分析。
2、2、宏基因組16S rDNA單V區測序
對16s rDNA的單V區(V3V4)進行高通量測序，鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區並結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環境細菌進行瞭鑒定。
3    3、Small RNA測序
1*35bp的讀長完美地配合瞭小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術團隊目前已完成瞭鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。
4、4、重測序：包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用於對微生物基因組的重測序，每次運行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術團隊利用MiSeq一次運行同時完成瞭乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組覆蓋率為100%，同時檢測到瞭多種結構變異，包括插入、缺失和SNP位點，並且檢測到瞭全部質粒。