設計用於合成結構上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器。一般應用於固相合成法，每次將一個核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上，加入每一個核苷酸都利用相同的化學反應與相應的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。所用化學反應和操作細節隨不同的儀器而改變，最廣泛應用的方法是DNA合成的磷酸酰胺法。
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